Sáng thứ 6 ngày 6/9/2024, Đức Thánh Cha đã từ giã Indonesia và bắt đầu chặng thứ hai của chuyến tông du với cuộc viếng thăm Papua New Guinea, từ chiều thứ Sáu ngày 6/9/2024 đến trưa Chúa Nhật ngày 9/9/2024. Vào lúc 10:37, chiếc máy bay A 330 của hãng hàng không Garuda của Indonesia chở Đức Thánh Cha và đoàn tùy tùng đã cất cánh rời phi trường Jakarta Soekarno-Hatta và dự kiến sẽ đến thủ đô Port Moresby của Papua New Guinea sau 6 giờ bay.
Vào khoảng 8:30 sáng, sau khi dâng lễ riêng tại Tòa Sứ Thần ở Jakarta và chào từ biệt các nhân viên và ân nhân của Toà Sứ thần, Đức Thánh Cha đi xe đến sân bay quốc tế Jakarta cách đó gần 30km.
Nhiều bạn trẻ và cả các bà mẹ với em bé đứng dọc đường đi bày tỏ lòng quý mến với Đức Thánh Cha và chào từ biệt ngài.
Đến phi trường trong chiếc xe Toyota màu trắng, phương tiện di chuyển của ngài trong những ngày viếng thăm Indonesia, Đức Thánh Cha đã chào từ biệt ông Yaqut Cholil Qoumas, Bộ trưởng Tôn giáo của Indonesia. Ông Qoumas cũng cảm ơn Đức Thánh Cha về cuộc viếng thăm của ngài.
Hiện diện tại sân bay để từ biệt Đức Thánh Cha còn có Đức Hồng y Ignatius Suharyo Hardjoatmodjo, Tổng Giám mục Jakarta, đại diện Tòa Sứ Thần tại Jakarta và một số quan chức của Indonesia.
Ngồi trên xe lăn đi lên máy bay, Đức Thánh Cha cũng chào và chúc lành cho tất cả những người đến gần ngài, cúi đầu xin ngài chúc lành, trong bầu khí vui mừng và kính trọng dành cho vị lãnh đạo Giáo hội Công giáo.
Vào lúc 10:37 giờ Jakarta, chiếc máy bay A330 của hãng hàng không Garuda của Indonesia đã cất cánh rời sân bay Jakarta Soekarno-Hatta bay đến thủ đô Port Moresby của Papua New Guinea.
Như thông lệ, Đức Thánh Cha đã gửi điện thư chào thăm Tổng thống Indonesia khi bay qua không phận nước này để đến Papua New Guinea.
Sau khi bay qua 4.693km, với khoảng sau 6 giờ bay, máy bay đáp xuống sân bay Port Moresby.