Vào lúc 9 giờ sáng thứ Tư ngày 23/4/2025, thi hài Đức Thánh Cha Phanxicô được đặt trong quan tài mở đã được rước vào Đền thờ Thánh Phêrô. Từ trưa ngày này cho đến 7 giờ tối thứ Sáu ngày 25/4/2025, các tín hữu có thể đến kính viếng và cầu nguyện cho Đức cố Giáo hoàng.
Nghi thức Di quan bắt đầu lúc đúng 9 giờ tại Nhà nguyện của Nhà Thánh Marta, nơi cư trú của Đức Thánh Cha trong 12 năm Giáo hoàng, khi ca đoàn hát lời tuyên bố của Chúa Giêsu: “Thầy là sự sống lại và là sự sống. Ai tin vào Thầy, thì dù đã chết, cũng sẽ được sống. Ai sống và tin vào Thầy, sẽ không bao giờ phải chết.”
Vào đầu Nghi lễ, Đức Hồng y Kevin Farrell, Hồng y Nhiếp chính của Giáo hội sau khi Đức Thánh Cha qua đời, chủ sự Nghi lễ, nói với các Hồng y, Giám mục, và một số linh mục, tu sĩ và giáo dân hiện diện: “Với niềm tiếc thương sâu sắc, giờ đây chúng ta tiễn đưa thi hài Đức Giáo hoàng Phanxicô của chúng ta vào Đền thờ Thánh Phêrô tại Vatican – nơi ngài đã nhiều lần thi hành sứ vụ của Giám mục Giáo phận Roma và sứ vụ của vị Mục tử của Giáo hội hoàn vũ.”
Đức Hồng y mời gọi cộng đoàn cảm tạ Thiên Chúa vì muôn vàn hồng ân mà Người đã tuôn đổ trên đoàn dân Kitô giáo qua tôi tớ của Người là Đức Giáo hoàng Phanxicô và cầu xin Chúa, nhờ lòng thương xót và nhân hậu của Người, ban cho Đức cố Giáo hoàng nơi an nghỉ vĩnh hằng trong Nước Trời, và ban ơn an ủi nhờ niềm hy vọng thiên quốc cho gia quyến của ngài, cho Giáo hội tại Roma, cũng như toàn thể tín hữu trên khắp thế giới.
Đoàn rước bắt đầu từ Nhà nguyện Nhà Thánh Marta, tiến ra Quảng trường các vị Tử đạo tiên khởi của Roma, sau đó đi ra khỏi Cửa Chuông và tiến ra Quảng trường Thánh Phêrô. Đây cũng là hành trình của Đức Thánh Cha vào Chúa Nhật Phục Sinh khi ngài từ trên chiếc xe papamobile tiến ra Quảng trường để chào đông đảo các tín hữu.
Khi quan tài mang thi hài của Đức Thánh Cha đến Quảng trường, các tín hữu đã vỗ tay chào vị Cha chung. Đặc biệt, khi quan tài bắt đầu tiến vào Đền thờ, những tràng vỗ tay lớn hơn và dài hơn, như cùng chào mừng ngài trở lại nhà của ngài, vào nơi ngài đã thi hành thừa tác vụ lãnh đạo Giáo hội mà Chúa trao phó.
Thi hài Đức Thánh Cha được đồng hành bởi lời kinh cầu các Thánh, xin các thánh và các thiên thần chuyển cầu cho ngài trước tòa Chúa và dẫn đưa ngài trên hành trình về Thiên quốc.
Sau khi lắng nghe đoạn Tin Mừng Thánh Gioan, trong đó nhắc lại lời cầu nguyện của Chúa Giêsu: “Lạy Cha, con muốn rằng con ở đâu, thì những người Cha đã ban cho con cũng ở đó với con, để họ chiêm ngưỡng vinh quang của con, vinh quang mà Cha đã ban cho con, vì Cha đã yêu thương con trước khi thế gian được tạo thành" - cộng đoàn cùng dâng lời nguyện chung cầu nguyện cho Đức cố Giáo hoàng Phanxicô, cho Hội Thánh, cho các dân tộc trên thế giới và cho cộng đoàn đang hiện diện trong cầu nguyện.
Nghi thức Di quan kết thúc với lời Kinh Lạy Nữ Vương, phó thác Đức cố Giáo hoàng Phanxicô cho Đức Maria, người Mẹ mà ngài hết lòng yêu mến và tin tưởng, xin Mẹ chuyển cầu và đưa ngài đến với Chúa Giêsu, Con của Mẹ.